W większości stajni usuwanie odchodów nie jest zmechanizowane. Taczki, widły i miotły to podstawowe narzędzia używane przy czyszczeniu stajni.
Po zakończeniu pracy wszystkie używane narzędzia należy odstawić w bezpieczne miejsce, gdyż porzucone tam, gdzie przebywają konie zagrażają zarówno im, jak i pracującym ludziom
Odchody zwierzęce są wartościowym nawozem naturalnym, zawierającym przede wszystkim związki azotu stosowane do nawożenia roślin. Dodatkowo poprawiają strukturę gleby.
Usunięty ze stajni obornik najczęściej jest składowany na pryzmach lub bezpośrednio na przyczepach i stąd wywożony na pole. Przy składowaniu nawozu naturalnego, niezależnie od jego postaci, należy pamiętać o zachowaniu stref ochronnych i stosowaniu płyt obornikowych, gdyż nieumiejętne składowanie nawozu może doprowadzić do zanieczyszczenia wód gruntowych i powierzchniowych.